Merkezimizde Biyolojik bilimlerin, diğer disiplinlerle birlikte çalışarak Biyoteknoloji ve Nanobiyoteknoloji alanlarında akademik eser ve ürün çıkarması için gerekli altyapı sunulmaktadır. Bunun için Bakteriyoloji, Maya, İleri Ökaryotlar, Küf mantarları, Protein Mühendisliği gibi konuları içeren temel biyoloji laboratuvarları dışında, merkezin amacını oluşturan ve biyolojik bilimlerin diğer temel bilimler ve mühendislik alanlarıyla kesişiminden doğan uygulamalı konuların çalışılabilmesini sağlayan, Fermantasyon, Çevre Biyoteknolojisi, Uygulama Laboratuvarları, vb laboratuvar altyapıları mevcuttur. Ayrıca Nanobiyoteknoloji ve disiplinler arası diğer yeni konularda yapılan çalışmaları desteklemek için Biyobenzetim laboratuvarı gibi laboratuvarlar ve tüm bu çalışmaların çağı yakalayan bir kalitede gerçekleşmesini sağlamak için son teknoloji ile donatılmış ve çoğunluğu DPT İleri Teknolojiler Altyapı Projesi ile gerçekleştirilmiş, Enstrümantasyon, Karakterizasyon ve Mikroskopi laboratuvarları mevcuttur.

Merkezimizin diğer önemli amacı endüstri-üniversite arakesitini sağlıklı ve verimli bir biçimde oluşturmaktır. Bunun için Merkezimizde Endüstriyel İşbirliği Laboratuvarı bulunmaktadır. Bu laboratuvar endüstriyel uygulamalara altyapı desteği sağlamakta, bir yandan da uzmanlık gerektiren konularda endüstriye servis verebilmektedir. Altta katlar itibariyle laboratuvarların dağılımı verilmiştir:

Üçüncü Kat Laboratuvarları:

1.    Fermentasyon

2.    Çevre Biyoteknolojisi

3.    Kimyasal Hazırlık Odası

4.    Enstrümantasyon

5.    Maya

6.    Bakteriyoloji

7.    Biyobenzetim

İkinci Kat Laboratuvarları:

1.    Uygulama Laboratuvarı

2.    Endüstriyel İşbirliği Laboratuvarı

Bodrum Katı:

1.    Protein Mühendisliği

2.    Moleküler Evrim

3.    Karakterizasyon

4.    İleri Ökaryotlar

5.    Sterilizasyon Odası

6.    Mikroskopi Odası